RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 STYXL1Q9Y6J8 313 aa18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ACKR2O00590 384 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PMM2O15305 246 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSEN2P49810 448 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPN14Q15678 1187 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM63BQ5T3F8 832 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 RRAGAQ7L523 313 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 VPS36Q86VN1 386 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 C7orf31Q8N865 590 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC42Q96M95 316 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TTYH3Q9C0H2 523 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TIMP1P01033 207 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MXI1P50539 228 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLCN3P51790 818 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHMP4BP1P59074 171 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTENP60484 403 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPA17Q15506 151 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 GNASQ5JWF2 1037 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 NLRP7Q8WX94 980 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MFSD14AQ96MC6 490 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXL18Q96ME1 805 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARVCFO00192 962 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 OFD1O75665 1012 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERLIN2O94905 339 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNMA1Q12791 1236 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MEA1Q16626 185 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT39Q6A163 491 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PDXDC1Q6P996 788 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 RSPH3Q86UC2 560 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 NME8Q8N427 588 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYLIPQ8WY64 445 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MROH7Q68CQ1 1323 aa18.18■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A0C4DFX4 3053 aa18.17■□□□□ 0.5
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TRAPPC3-210ENST00000617904 C17orf102A2RUQ5 167 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANXA13P27216 316 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 BEX3Q00994 111 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYP24A1Q07973 514 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PSMD6Q15008 389 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ASIC2Q16515 512 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM187BQ17R55 369 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MFSD5Q6N075 450 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 EHBP1Q8NDI1 1231 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 SAAL1Q96ER3 474 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 FZD8Q9H461 694 aa18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa18.17■□□□□ 0.5
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TRAPPC3-210ENST00000617904 M0QZ92 97 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 OGTO15294 1046 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERPING1P05155 500 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM49P0CI25 452 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM49CP0CI26 452 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 UCHL3P15374 230 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 FERP16591 822 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PON1P27169 355 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADSSP30520 456 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 STAT1P42224 750 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLK7P49862 253 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAPGEF1Q13905 1077 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.16■□□□□ 0.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa18.16■□□□□ 0.5
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