RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 GAP43P17677 238 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 LIG1P18858 919 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ABCD1P33897 745 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 GRIK3Q13003 919 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ADAM15Q13444 863 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 SFR1Q86XK3 245 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 FAM178BQ8IXR5 827 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 TLR9Q9NR96 1032 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 KLK14Q9P0G3 267 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PARP2Q9UGN5 583 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 KCNH3Q9ULD8 1083 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa17■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 A0A0B4J269 797 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 A0A1W2PQ27 194 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 A0A1W2PQ64 194 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 A0A1W2PQD8 194 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 NCK2O43639 380 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 BMP1P13497 986 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 KCNE1P15382 129 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 KRT17Q04695 432 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 STRN3Q13033 797 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 STAMQ92783 540 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 HVCN1Q96D96 273 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 SPATA32Q96LK8 384 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 APOL6Q9BWW8 343 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ZBP1Q9H171 429 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.99■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 SLFN14P0C7P3 912 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 CTSAP10619 480 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 CASP5P51878 434 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 KCNA1Q09470 495 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 TUSC3Q13454 348 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ZBTB6Q15916 424 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 GPR65Q8IYL9 337 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 HLA-CQ95604 372 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 DHX58Q96C10 678 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ASB2Q96Q27 587 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 CHST7Q9NS84 486 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 THEGQ9P2T0 379 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 VCANP13611 3396 aa16.98■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 TTC26A0AVF1 554 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 HIDE1A8MVS5 230 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 K7ENM7 598 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 CLDN3O15551 220 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 THP07101 528 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ADSSP30520 456 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 HOXD13P35453 343 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 AMPD3Q01432 767 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 DUSP6Q16828 381 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ZNF568Q3ZCX4 644 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 EFHBQ8N7U6 833 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 TMEM169Q96HH4 297 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 ACAP3Q96P50 834 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PANK4Q9NVE7 773 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 CNTN3Q9P232 1028 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 STK39Q9UEW8 545 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 GDAQ9Y2T3 454 aa16.97■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 A0A1B0GVL5 298 aa16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 F8W810 466 aa16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 KLRC4O43908 158 aa16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 GLP2RO95838 553 aa16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 PFKFB1P16118 471 aa16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 TFF2Q03403 129 aa16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
BECN1-211ENST00000589636 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms