RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	LPP	Q93052	612 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SNX27	Q96L92	541 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	GDF15	Q99988	308 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF18	P17022	549 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF165	P49910	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	MYL5	Q02045	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	IKBKE	Q14164	716 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TSG101	Q99816	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TTC26	A0AVF1	554 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	PTGES	O14684	152 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	IKBKB	O14920	756 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	CLTA	P09496	248 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	FGFR1	P11362	822 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	AKAP5	P24588	427 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	GATM	P50440	423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	OSTN	P61366	133 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.71	□□□□□ -0.21
DNMT1-208	ENST00000586667	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	MAPK13	O15264	365 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	B4GALT3	O60512	393 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	EXOC3	O60645	756 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	EFCAB14	O75071	495 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	MLH1	P40692	756 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	ADAM9	Q13443	819 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	NAB2	Q15742	525 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.7	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	CETN3	O15182	167 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	CAVIN2	O95810	425 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	EOMES	O95936	686 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	FGB	P02675	491 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	NFIC	P08651	508 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	SKI	P12755	728 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	ACTN1	P12814	892 aa		13.69	□□□□□ -0.22
DNMT1-208	ENST00000586667	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms