RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 MYH11P35749 1972 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.45■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 PLA2G5P39877 138 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 NPTX2P47972 431 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 DSG1Q02413 1049 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 TUSC3Q13454 348 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM122AQ96E09 287 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 PNMA5Q96PV4 448 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 PLIN2Q99541 437 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 SFXN1Q9H9B4 322 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.44■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 SFI1A8K8P3 1242 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 TADA2AO75478 443 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 THP07101 528 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 ADH1AP07327 375 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 MYBP10242 640 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 MAPK7Q13164 816 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 PTPN21Q16825 1174 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 HYIQ5T013 277 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 GPR149Q86SP6 731 aa23.43■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 MUC6Q6W4X9 2439 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM221A6NGB7 291 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 M0R296 226 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 NAB2Q15742 525 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 USP41Q3LFD5 358 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 HASPINQ8TF76 798 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 DRC1Q96MC2 740 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.42■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 SPATA31D3P0C874 917 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 ZBTB33Q86T24 672 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 PALB2Q86YC2 1186 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.41■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 GLUD1P00367 558 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 GUCY2CP25092 1073 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.4■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.39■■□□□ 1.34
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC16A4O15374 487 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 KIF4AO95239 1232 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 SIGLEC14Q08ET2 396 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 RTP2Q5QGT7 225 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 CEP120Q8N960 986 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.335e-6■■■■■ 52.7
CSNK1D-215ENST00000580784 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC12A3P55017 1021 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 GPR65Q8IYL9 337 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 TIPINQ9BVW5 301 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 CDT1Q9H211 546 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 FNIP2Q9P278 1114 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 USTQ9Y2C2 406 aa23.38■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 VWA8A3KMH1 1905 aa23.37■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 TGM5O43548 720 aa23.37■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 RFPL2O75678 378 aa23.37■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 ASGR2P07307 311 aa23.37■■□□□ 1.33
CSNK1D-215ENST00000580784 PLA2G4BP0C869 781 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms