RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAS1R3Q7RTX0 852 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP2C8P10632 490 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SOCS7O14512 581 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TGFB3P10600 412 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANXA13P27216 316 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COPB2P35606 906 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STAT5BP51692 787 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPC2Q52LR7 807 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 METTL7BQ6UX53 244 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 P4HA2O15460 535 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZEB2O60315 1214 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 METTL13Q8N6R0 699 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP20Q9Y2K6 914 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP104O60308 925 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NR1D1P20393 614 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PORCNQ9H237 461 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLAAQ9Y263 795 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LSP1P33241 339 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCN4AP35499 1836 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0YCG3 227 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GLRA2P23416 452 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GUCY1A3Q02108 690 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CUL1Q13616 776 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPROQ16827 1216 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP89Q96ST8 783 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFAB1O14561 156 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RFX1P22670 979 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MROH8Q9H579 483 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0YGN5 161 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MARK3P27448 753 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LIG4P49917 911 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPD1LQ8N335 351 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASGEF1CQ8N431 466 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DEPTORQ8TB45 409 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXL18Q96ME1 805 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AP1M1Q9BXS5 423 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AZI2Q9H6S1 392 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMBIM4Q9HC24 238 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NFS1Q9Y697 457 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MCM3APO60318 1980 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SART1O43290 800 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSD17B3P37058 310 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STRN3Q13033 797 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM50Q86XT4 487 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPN3Q9H201 632 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H2AFZP0C0S5 128 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms