RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	NRG3	P56975	720 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ZXDA	P98168	799 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	CHPF	Q8IZ52	775 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431		Q9UFV3	132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	DAPK3	O43293	454 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	CREB3	O43889	395 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	KNG1	P01042	644 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	PFKM	P08237	780 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	STIL	Q15468	1287 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	INAVA	Q3KP66	663 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	KANK2	Q63ZY3	851 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SHPRH	Q149N8	1683 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ADGRB2	O60241	1585 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	DLC1	Q96QB1	1528 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ABCC11	Q96J66	1382 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	LRP6	O75581	1613 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	TRIM75P	A6NK02	468 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431		K7ESM1	405 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	OVOL3	O00110	214 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	CUTA	O60888	179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	PF4V1	P10720	104 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	POLD1	P28340	1107 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	STAT5B	P51692	787 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	MAN2A1	Q16706	1144 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	BRINP3	Q76B58	766 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	MIER2	Q8N344	545 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	PMM1	Q92871	262 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	TEKT5	Q96M29	485 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	WDR92	Q96MX6	357 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	USP32	Q8NFA0	1604 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431		A0A1B0GTL3	188 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	FFAR3	O14843	346 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	PCDHGA12	O60330	932 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	FSBP	O95073	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SCGB1D2	O95969	90 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ATF3	P18847	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	VCAM1	P19320	739 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	AGXT	P21549	392 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	GPR15	P49685	360 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC16A1	P53985	500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	SLURP1	P55000	103 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	RRAD	P55042	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	HTRA3	P83110	453 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	MGAT5	Q09328	741 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	LRRC41	Q15345	812 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	MUM1	Q2TAK8	710 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LRRC28-222	ENST00000561431	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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