RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXL18Q96ME1 805 aa20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPRSQ13332 1948 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBBXA8MT70 800 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CETN3O15182 167 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 EXTL3O43909 919 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 BAIAP3O94812 1187 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 SKIP12755 728 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITGA4P13612 1032 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 PARP2Q9UGN5 583 aa20.34■□□□□ 0.85
USP3-AS1-203ENST00000559737 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 EFCAB14O75071 495 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 AKAP3O75969 853 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 RECQL4O94761 1208 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADRB2P07550 413 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLTAP09496 248 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA1Q5VX52 437 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 HERVK_113Q902F9 699 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACAP3Q96P50 834 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 GDF15Q99988 308 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CBX8Q9HC52 389 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANK1P16157 1881 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 UPP2O95045 317 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 EOMESO95936 686 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CXCL8P10145 99 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYL5Q02045 173 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCAPHQ15003 741 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 IQCB1Q15051 598 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PGBD4Q96DM1 585 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP63Q96MT8 703 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLK14Q9P0G3 267 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF233A6NK53 670 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMHP03971 560 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGFR1P11362 822 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNJ6P48051 423 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 WNT7BP56706 349 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 KYAT1Q16773 422 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 HACE1Q8IYU2 909 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF19AQ9NV58 838 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SHHQ15465 462 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOP1MTQ969P6 601 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM212AQ96EL1 285 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZFP42Q96MM3 310 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 RSAD1Q9HA92 442 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FANCLQ9NW38 375 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTC26A0AVF1 554 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 LACTBL1A8MY62 500 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 IKBKBO14920 756 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAVIN2O95810 425 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 GATMP50440 423 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP24A1Q07973 514 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 RASIP1Q5U651 963 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms