RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559192.5

USP3-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3, Length 5,499 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-210ENST00000559192 WDR11Q9BZH6 1224 aa7.56□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 JMJD4Q9H9V9 463 aa7.56□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ZBBXA8MT70 800 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ARHGEF9O43307 516 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CYP11B2P19099 503 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 NEK2P51955 445 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 OVGP1Q12889 678 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 AOC3Q16853 763 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 EPC2Q52LR7 807 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 TEX9Q8N6V9 391 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 MIEF2Q96C03 454 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 TJP3O95049 919 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 BPIFB4P59827 614 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 KCNK18Q7Z418 384 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CD302Q8IX05 232 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 NME8Q8N427 588 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 LXNQ9BS40 222 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 DRC3Q9H069 523 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 PFASO15067 1338 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 F5H423 210 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ASAP2O43150 1006 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 EYA4O95677 639 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 KLC1Q07866 573 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 COG2Q14746 738 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ACCSLQ4AC99 568 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CCDC17Q96LX7 622 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CD209Q9NNX6 404 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 GRIN2DO15399 1336 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 RICTORQ6R327 1708 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CASZ1Q86V15 1759 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CLRN2A0PK11 232 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 COPEO14579 308 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 MCF2LO15068 1137 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 KDM1AO60341 852 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ITIH2P19823 946 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CPA2P48052 419 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 KDSRQ06136 332 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 NR1H3Q13133 447 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 STAT4Q14765 748 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ZBTB33Q86T24 672 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CCDC125Q86Z20 511 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 JDP2Q8WYK2 163 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 TATDN2Q93075 761 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CSRNP1Q96S65 589 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 RIPK2O43353 540 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 GSTA1P08263 222 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 EPHB1P54762 984 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ARL4CP56559 192 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ZNF543Q08ER8 600 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 TMEM270Q6UE05 265 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 DCAF4Q8WV16 495 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 BAP1Q92560 729 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 CEP170P1Q96L14 293 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 HAUS8Q9BT25 410 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.55□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 AKAP3O75969 853 aa7.54□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 SGPL1O95470 568 aa7.54□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 PGM1P36871 562 aa7.54□□□□□ -1.2
USP3-210ENST00000559192 KCNJ2P63252 427 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms