RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.61■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 ZMYND15Q9H091 742 aa22.61■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.61■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 KCNK3O14649 394 aa22.6■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.6■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 OGFRQ9NZT2 677 aa22.6■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.6■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 AFG1LQ8WV93 481 aa22.6■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 RAB21Q9UL25 225 aa22.59■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 MSCO60682 206 aa22.59■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 CCNA1P78396 465 aa22.59■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.59■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.59■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 MORC4Q8TE76 937 aa22.59■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 RFX1P22670 979 aa22.58■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 RPS6KA1Q15418 735 aa22.58■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.58■■□□□ 1.21
PRDM4-205ENST00000550376 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 GPR142Q7Z601 462 aa22.58■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.58■■□□□ 1.21
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PRDM4-205ENST00000550376 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.57■■□□□ 1.2
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PRDM4-205ENST00000550376 IQCF3P0C7M6 154 aa22.57■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 MYBL2P10244 700 aa22.57■■□□□ 1.2
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PRDM4-205ENST00000550376 CEP120Q8N960 986 aa22.57■■□□□ 1.2
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PRDM4-205ENST00000550376 USP37Q86T82 979 aa22.57■■□□□ 1.2
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PRDM4-205ENST00000550376 KIF4AO95239 1232 aa22.56■■□□□ 1.2
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PRDM4-205ENST00000550376 ANXA13P27216 316 aa22.56■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 BRD3Q15059 726 aa22.56■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 ZACNQ401N2 412 aa22.56■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 C2CD6Q53TS8 623 aa22.56■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.56■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.56■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PRDM4-205ENST00000550376 LGALS2P05162 132 aa22.56■■□□□ 1.2
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