RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 GCNT3O95395 438 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.094e-10■■□□□ 11.6
CS-212ENST00000548567 NPTX2P47972 431 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ANAPC15P60006 121 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 Q4G0T1 1027 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 RTP2Q5QGT7 225 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ADALQ6DHV7 355 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NACC1Q96RE7 527 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TEX28O15482 410 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PLA2G4BP0C869 781 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MTA3Q9BTC8 594 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 BIN1O00499 593 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 KIF4AO95239 1232 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CPB1P15086 417 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CYP2J2P51589 502 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 RGS18Q9NS28 235 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ZZEF1O43149 2961 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PRRG1O14668 218 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 DGAT1O75907 488 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 WEE1P30291 646 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 RFC2P35250 354 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 LIG4P49917 911 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CES5AQ6NT32 575 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NOTUMQ6P988 496 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 RNF135Q8IUD6 432 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 URGCPQ8TCY9 931 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TNFRSF25Q93038 417 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 REEP2Q9BRK0 252 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CLEC1BQ9P126 229 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CACNA1AO00555 2505 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 URODP06132 367 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PDGFRBP09619 1106 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CASP4P49662 377 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SLC26A2P50443 739 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 EVCP57679 992 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 STRN3Q13033 797 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CACUL1Q86Y37 369 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 GIPC2Q8TF65 315 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 KIF12Q96FN5 646 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CALML4Q96GE6 196 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MTMR9Q96QG7 549 aa8.26□□□□□ -1.09
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CS-212ENST00000548567 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CWH43Q9H720 699 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 CLDN3O15551 220 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 STX6O43752 255 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 MYL4P12829 197 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 PTENP60484 403 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 GRM2Q14416 872 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TAF12Q16514 161 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 HS1BP3Q53T59 392 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 RRAGBQ5VZM2 374 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-212ENST00000548567 TSSK4Q6SA08 328 aa8.25□□□□□ -1.09
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