RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543185.5

HDAC4-215, Transcript of histone deacetylase 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HDAC4, Length 8,990 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4-215ENST00000543185 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.4■□□□□ 0.86
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HDAC4-215ENST00000543185 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.4■□□□□ 0.86
HDAC4-215ENST00000543185 COQ7Q99807 217 aa20.4■□□□□ 0.86
HDAC4-215ENST00000543185 KLHL31Q9H511 634 aa20.4■□□□□ 0.86
HDAC4-215ENST00000543185 ABCA8O94911 1581 aa20.4■□□□□ 0.86
HDAC4-215ENST00000543185 CHN1P15882 459 aa20.39■□□□□ 0.86
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HDAC4-215ENST00000543185 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.39■□□□□ 0.85
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HDAC4-215ENST00000543185 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.38■□□□□ 0.85
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HDAC4-215ENST00000543185 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.38■□□□□ 0.85
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HDAC4-215ENST00000543185 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.38■□□□□ 0.85
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HDAC4-215ENST00000543185 MAFGO15525 162 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 CD58P19256 250 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 CDO1Q16878 200 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.37■□□□□ 0.85
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HDAC4-215ENST00000543185 BCAR1P56945 870 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 VPS50Q96JG6 964 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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HDAC4-215ENST00000543185 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 ZNF197O14709 1029 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.37■□□□□ 0.85
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HDAC4-215ENST00000543185 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 VPS37AQ8NEZ2 397 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 VPS33BQ9H267 617 aa20.37■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 TRIM49P0CI25 452 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 TRIM49CP0CI26 452 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 ADD2P35612 726 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 RIN3Q8TB24 985 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 RTN2O75298 545 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 TMEM270Q6UE05 265 aa20.36■□□□□ 0.85
HDAC4-215ENST00000543185 KCNB1Q14721 858 aa20.36■□□□□ 0.85
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