RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 STK39Q9UEW8 545 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG1-211ENST00000539921 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SNHG1-211ENST00000539921 PNMA2Q9UL42 364 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG1-211ENST00000539921 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG1-211ENST00000539921 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG1-211ENST00000539921 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.53□□□□□ -1.36
SNHG1-211ENST00000539921 MYH8P13535 1937 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KCNJ18B7U540 433 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 C2CD2LO14523 706 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CPLX1O14810 134 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FYB1O15117 783 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DNAJC6O75061 913 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TBX10O75333 385 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TOMM70O94826 608 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UFL1O94874 794 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UPP2O95045 317 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TNFAIP8O95379 198 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CLPTM1O96005 669 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 A1BGP04217 495 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 HSPA6P17066 643 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CTRB1P17538 263 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MUTP22033 750 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IL32P24001 234 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UBA7P41226 1012 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PTGER2P43116 358 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GJA9P57773 515 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 COX10Q12887 443 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NR1H3Q13133 447 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PAK1Q13153 545 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 STK3Q13188 491 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 APOFQ13790 326 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LRP8Q14114 963 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KCNJ12Q14500 433 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KRT81Q14533 505 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MAPRE2Q15555 327 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RGS21Q2M5E4 152 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ADSSL1Q8N142 457 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LZTR1Q8N653 840 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GIPC3Q8TF64 312 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NRG4Q8WWG1 115 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 JADE3Q92613 823 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 JPH4Q96JJ6 628 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 C8orf48Q96LL4 319 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 C7orf26Q96N11 449 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FMO2Q99518 471 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TTC1Q99614 292 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KLC2Q9H0B6 622 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CUEDC2Q9H467 287 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PPCSQ9HAB8 311 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 VPS45Q9NRW7 570 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MKS1Q9NXB0 559 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NDE1Q9NXR1 346 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NID2Q14112 1375 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PTPRMP28827 1452 aa6.52□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DYTNA2CJ06 578 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms