RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536797.5

LPCAT3-204, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

TSL 2

Gene LPCAT3, Length 1,412 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-204ENST00000536797 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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LPCAT3-204ENST00000536797 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 FGF18O76093 207 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 SLC34A2O95436 690 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 MYL1P05976 194 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 MYBP10242 640 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 PBX3P40426 434 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 CASP5P51878 434 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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LPCAT3-204ENST00000536797 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.96■■□□□ 1.27
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LPCAT3-204ENST00000536797 ACCSQ96QU6 501 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-204ENST00000536797 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.96■■□□□ 1.27
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LPCAT3-204ENST00000536797 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.95■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.95■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 UBE3AQ05086 875 aa22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.94■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.94■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.93■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 PLCB3Q01970 1234 aa22.93■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.93■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.93■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.93■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 CITO14578 2027 aa22.93■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 DSC1Q08554 894 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 KYAT1Q16773 422 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 TMEM169Q96HH4 297 aa22.92■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 A0A0B4J269 797 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 PTGESO14684 152 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 OGTO15294 1046 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 OR1G1P47890 313 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 SEZ6Q53EL9 994 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 PPM1EQ8WY54 764 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 EXOC1Q9NV70 894 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 LZTS1Q9Y250 596 aa22.91■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 NRP1O14786 923 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 KLRC4O43908 158 aa22.91■■□□□ 1.26
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LPCAT3-204ENST00000536797 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 IGSF21Q96ID5 467 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 SNX27Q96L92 541 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 TLR9Q9NR96 1032 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-204ENST00000536797 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.9■■□□□ 1.26
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