RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 TRIM9Q9C026 710 aa20.47■□□□□ 0.87
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PUF60-218ENST00000531995 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.47■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ZNF202O95125 648 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 BCAR1P56945 870 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ZXDAP98168 799 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PPP2R5AQ15172 486 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 S1PR5Q9H228 398 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 USP20Q9Y2K6 914 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 MYH11P35749 1972 aa20.46■□□□□ 0.87
PUF60-218ENST00000531995 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 USP34Q70CQ2 3546 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.45■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 SLC16A4O15374 487 aa20.45■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 FAM187BQ17R55 369 aa20.45■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.45■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.45■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 TMEM169Q96HH4 297 aa20.45■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 FAM13AO94988 1023 aa20.44■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 UBXN11Q5T124 520 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 MYCT1Q8N699 235 aa20.44■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 ZBP1Q9H171 429 aa20.43■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.42■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 SFR1Q86XK3 245 aa20.42■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 VPS52Q8N1B4 723 aa20.42■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 CPB2Q96IY4 423 aa20.42■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.42■□□□□ 0.86
PUF60-218ENST00000531995 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.42■□□□□ 0.86
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PUF60-218ENST00000531995 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.42■□□□□ 0.86
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