RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 MTMR1Q13613 665 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PCGF5Q86SE9 256 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 RUNDC1Q96C34 613 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 USP19O94966 1318 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 NHSL1Q5SYE7 1610 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP69A5D8W1 941 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CYP17A1P05093 508 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ETV4P43268 484 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 EPHB4P54760 987 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ITKQ08881 620 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRC-214ENST00000530727 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 LOXL4Q96JB6 756 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CDH19Q9H159 772 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 NUDCQ9Y266 331 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 SBNO1A3KN83 1393 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 COL18A1P39060 1754 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0G2JNJ9 132 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SLC9A1P19634 815 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MOGSQ13724 837 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MLC1Q15049 377 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF827Q17R98 1081 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF280DQ6N043 979 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 BRINP3Q76B58 766 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MYRIPQ8NFW9 859 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 FOXB1Q99853 325 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ZHX3Q9H4I2 956 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 Q9UFV3 132 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SCINQ9Y6U3 715 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 FLT4P35916 1363 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RGPD5Q99666 1765 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RTL1A6NKG5 1358 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 KDRP35968 1356 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 EYA4O95677 639 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SLC6A3Q01959 620 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ROM1Q03395 351 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SLFN5Q08AF3 891 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K12Q12852 859 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MORC3Q14149 939 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 SLFN13Q68D06 897 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 KIF18BQ86Y91 864 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-214ENST00000530727 NXPE1Q8N323 547 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-214ENST00000530727 MTMR8Q96EF0 704 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PTPN18Q99952 460 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 OXSMQ9NWU1 459 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 LZTS1Q9Y250 596 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 F2P00734 622 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 PRLP01236 227 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-214ENST00000530727 GCP02774 474 aa5.01□□□□□ -1.61
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