RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529748.1

SLC43A3-215, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 3

Gene SLC43A3, Length 397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-215	ENST00000529748	KIF4A	O95239	1232 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	RFC5	P40937	340 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	EVC	P57679	992 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	FZD5	Q13467	585 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CAPS	Q13938	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	NOTUM	Q6P988	496 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CNNM3	Q8NE01	707 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	DPP7	Q9UHL4	492 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	SPTLC1	O15269	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	NPTXR	O95502	500 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	C1R	P00736	705 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	C8A	P07357	584 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	TDGF1	P13385	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	AXL	P30530	894 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	HSPA4	P34932	840 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	GRIK3	Q13003	919 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	GPR65	Q8IYL9	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	ING5	Q8WYH8	240 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CCDC51	Q96ER9	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	MTR	Q99707	1265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	PTGES	O14684	152 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	GLRA2	P23416	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	NAB2	Q15742	525 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	POTED	Q86YR6	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	SHD	Q96IW2	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	BCO2	Q9BYV7	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SLC43A3-215	ENST00000529748	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SLC43A3-215	ENST00000529748	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.15	□□□□□ -0.63
SLC43A3-215	ENST00000529748	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63	5e-7	■■■■■ 51.7
SLC43A3-215	ENST00000529748	MYH11	P35749	1972 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SLC43A3-215	ENST00000529748	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SLC43A3-215	ENST00000529748	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SLC43A3-215	ENST00000529748	ASAP2	O43150	1006 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SLC43A3-215	ENST00000529748	CDC45	O75419	566 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SLC43A3-215	ENST00000529748	EDN1	P05305	212 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SLC43A3-215	ENST00000529748	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63

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