RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNJ18B7U540 433 aa24.75■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 EPHB4P54760 987 aa24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNJ12Q14500 433 aa24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 PLCB2Q00722 1185 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.74■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 MYBPC2Q14324 1141 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 RGS18Q9NS28 235 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 PARP2Q9UGN5 583 aa24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM49P0CI25 452 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM49CP0CI26 452 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.73■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 AP5Z1O43299 807 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 RECQL4O94761 1208 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 GRM5P41594 1212 aa24.73■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 CYP24A1Q07973 514 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0U1RQF3 1178 aa24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 C9IYK1 514 aa24.72■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.71■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 APBB2Q92870 758 aa24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFP42Q96MM3 310 aa24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS16Q9H269 839 aa24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1-208ENST00000524325 IL23AQ9NPF7 189 aa24.71■■□□□ 1.55
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TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.7■■□□□ 1.54
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TSNARE1-208ENST00000524325 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.7■■□□□ 1.54
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TSNARE1-208ENST00000524325 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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TSNARE1-208ENST00000524325 BFSP1Q12934 665 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 IKBKEQ14164 716 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 GSE1Q14687 1217 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF365Q70YC5 407 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 FSD2A1L4K1 749 aa24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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