RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517179.1

RNU6-111P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 111, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-111P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-111P-201ENST00000517179 TMCO4Q5TGY1 634 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 CHST14Q8NCH0 376 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 SARAFQ96BY9 339 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 RNF31Q96EP0 1072 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 BOD1Q96IK1 185 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 PHACTR3Q96KR7 559 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 GALNT9Q9HCQ5 603 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-111P-201ENST00000517179 PTPDC1A2A3K4 754 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 NRP2O60462 931 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 NTN1O95631 604 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ELANEP08246 267 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ITPKBP27987 946 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 TSHZ3Q63HK5 1081 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 LMBR1LQ6UX01 489 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 KCTD5Q9NXV2 234 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 A0A1W2PR48 441 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 PEX1O43933 1283 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 PRR35P0CG20 571 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 SLC9A1P19634 815 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 NRG3P56975 720 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 CXADRP78310 365 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 LLGL1Q15334 1064 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 UBE3CQ15386 1083 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZNF626Q68DY1 528 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZZZ3Q8IYH5 903 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 CABP5Q9NP86 173 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 USP18Q9UMW8 372 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 A0A1B0GTW7 788 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 CCDC151A5D8V7 595 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 CYSRT1A8MQ03 144 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 KCNQ2O43526 872 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 KELP23276 732 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 GPR15P49685 360 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 SOX10P56693 466 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 MGAT5Q09328 741 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 GRM1Q13255 1194 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 RAPGEF1Q13905 1077 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ETFDHQ16134 617 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 CCDC178Q5BJE1 867 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 SLC9A4Q6AI14 798 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 FGD2Q7Z6J4 655 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 LNX2Q8N448 690 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 MDM1Q8TC05 714 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 GAB3Q8WWW8 586 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 CCDC113Q9H0I3 377 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 BHMT2Q9H2M3 363 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 RNPEPQ9H4A4 650 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 WWOXQ9NZC7 414 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 SAMD15Q9P1V8 674 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 WNT6Q9Y6F9 365 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 KDM2BQ8NHM5 1336 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 INSIG1O15503 277 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 PJA2O43164 708 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 MOSPD3O75425 235 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ITGA10O75578 1167 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 SNHG28P0DPA3 235 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 FOLR3P41439 243 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 TSTD2Q5T7W7 516 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 AWAT2Q6E213 333 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 COLGALT2Q8IYK4 626 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 ZSWIM1Q9BR11 485 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 VPS33BQ9H267 617 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 NRIP3Q9NQ35 241 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 TOMM22Q9NS69 142 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-111P-201ENST00000517179 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms