RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 C11orf74Q86VG3 221 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF384Q8TF68 577 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 RSAD2Q8WXG1 361 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF31Q96EP0 1072 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP95Q96GE4 821 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q96MF0 132 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-277P-201ENST00000516272 KDM1AO60341 852 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFPL3O75679 317 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGLV2-14P01704 120 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFIP05156 583 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPN7P35236 360 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCNN1BP51168 640 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL2P60568 153 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAP2BP61225 183 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF480Q8WV37 535 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX33Q8WV41 574 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 CASS4Q9NQ75 786 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAST3O60307 1309 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 DRGXA6NNA5 263 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 MARCH11A6NNE9 402 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM127O75204 238 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 GASTP01350 101 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGALS4P56470 323 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHC1P78364 1004 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMC1BQ8NDV3 1235 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEU1Q99519 415 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD2APQ9Y5K6 639 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 LPLP06858 475 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTSSP25774 331 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRHR1P34998 444 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 ABCG1P45844 678 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 FLT3LGP49771 235 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLRN1P58418 232 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TERF2Q15554 542 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCEA2Q15560 299 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 METRNLQ641Q3 311 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6ZNX1 250 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 MED25Q71SY5 747 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR149Q86SP6 731 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 REPS2Q8NFH8 660 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM260Q9NX78 707 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF7Q9UBF6 113 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 KAT6AQ92794 2004 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADCY6O43306 1168 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 BROXQ5VW32 411 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPTORQ8N122 1335 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms