RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.1■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.1■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 BSNDQ8WZ55 320 aa22.1■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 C9IYK1 514 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 GCNT3O95395 438 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 PRKCBP05771 671 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 PNOCQ13519 176 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.09■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 TMEM206Q9H813 350 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.09■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 ACKR2O00590 384 aa22.08■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 LTBRP36941 435 aa22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 PPP1R2P41236 205 aa22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 CAMK1Q14012 370 aa22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 CCDC51Q96ER9 411 aa22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.08■■□□□ 1.13
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USP53-208ENST00000514305 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP53-208ENST00000514305 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 DNAJB1P25685 340 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP53-208ENST00000514305 GTF2BQ00403 316 aa22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 CLUL1Q15846 466 aa22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 NOTUMQ6P988 496 aa22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 GPT2Q8TD30 523 aa22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 BICD1Q96G01 975 aa22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 ACCSQ96QU6 501 aa22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.07■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 UBE4BO95155 1302 aa22.06■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 N4BP3O15049 544 aa22.06■■□□□ 1.12
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USP53-208ENST00000514305 GPR37L1O60883 481 aa22.06■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 ALADP13716 330 aa22.06■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 CASP1P29466 404 aa22.06■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
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USP53-208ENST00000514305 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.06■■□□□ 1.12
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USP53-208ENST00000514305 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.04■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP53-208ENST00000514305 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.04■■□□□ 1.12
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