RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 ADCY7P51828 1080 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ROM1Q03395 351 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 MAP3K12Q12852 859 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 RIN1Q13671 783 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 LCE1EQ5T753 118 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 SLFN12LQ6IEE8 588 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 KLHDC10Q6PID8 442 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 D2HGDHQ8N465 521 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 C16orf92Q96LL3 132 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 PCIF1Q9H4Z3 704 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 PIF1Q9H611 641 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 CABP5Q9NP86 173 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ACSS2Q9NR19 701 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 B4GALT6Q9UBX8 382 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 VWA7Q9Y334 891 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa3.95□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 H7C1D1 291 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 MAFGO15525 162 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 RHOBTB3O94955 611 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 PEX11BO96011 259 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 CYP17A1P05093 508 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 TSPY4P0CV99 314 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 TSPY10P0CW01 314 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 MYBPC3Q14896 1274 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF174Q15697 407 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 CFAP100Q494V2 611 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 TTC38Q5R3I4 469 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 CREB3L3Q68CJ9 461 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 CNPY4Q8N129 248 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ANKRD53Q8N9V6 530 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 RABGGTAQ92696 567 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 GPHA2Q96T91 129 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 DUOX2Q9NRD8 1548 aa3.94□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 MAP3K5Q99683 1374 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1W2PRX2 142 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 PMS2P1A4D2B8 440 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 CAPN14A8MX76 684 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 BPIFB4P59827 614 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ADAM8P78325 824 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 HHEXQ03014 270 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 DGKDQ16760 1214 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 E2F7Q96AV8 911 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 DYDC2Q96IM9 177 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 MSL2Q9HCI7 577 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 OXSMQ9NWU1 459 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM260Q9NX78 707 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 USP35Q9P2H5 1018 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 DNAI1Q9UI46 699 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 CD2APQ9Y5K6 639 aa3.93□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 UBE2QL1A1L167 161 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ZAR1LA6NP61 321 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 APOL3O95236 402 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 MCCP23508 829 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 FLT3P36888 993 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 TCIRG1Q13488 830 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 EPHA7Q15375 998 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 NXPE1Q8N323 547 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 DRC1Q96MC2 740 aa3.92□□□□□ -1.78
ATXN3-211ENST00000511362 WDR92Q96MX6 357 aa3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms