RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511273.1

CDH18-210, Transcript of cadherin 18, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CDH18, Length 2,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-210ENST00000511273 MAGEB2O15479 319 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NBR1Q14596 966 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SSH3Q8TE77 659 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.17□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SUV39H1O43463 412 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ALDH1A2O94788 518 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ITPKBP27987 946 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MAPK8P45983 427 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PHKA2P46019 1235 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SNAP25P60880 206 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 VITQ6UXI7 678 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TRIM50Q86XT4 487 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ITFG1Q8TB96 612 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 OXER1Q8TDS5 423 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PIGKQ92643 395 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 APC2O95996 2303 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 FGF19O95750 216 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PDHBP11177 359 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PTPN2P17706 415 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NDUFV2P19404 249 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 VAC14Q08AM6 782 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 Q6ZS52 159 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 STX8Q9UNK0 236 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 NFASCO94856 1347 aa7.16□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 A0A1W2PQD8 194 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 FAM193AP78312 1265 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 MAP7D2Q96T17 732 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 AMNQ9BXJ7 453 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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CDH18-210ENST00000511273 FRYLO94915 3013 aa7.15□□□□□ -1.26
CDH18-210ENST00000511273 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 EXTL3O43909 919 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 GPR32O75388 356 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 OFD1O75665 1012 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 CER1O95813 267 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 GBP1P32455 592 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 PLCB4Q15147 1175 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.15□□□□□ -1.27
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CDH18-210ENST00000511273 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 POM121Q96HA1 1249 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 TMEM209Q96SK2 561 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 MARCH5Q9NX47 278 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.15□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 TSPY2A6NKD2 308 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 AP5Z1O43299 807 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 TNFSF14O43557 240 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 POLR2MP0CAP2 368 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 TDO2P48775 406 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 EPHA5P54756 1037 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 RAB33AQ14088 237 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.14□□□□□ -1.27
CDH18-210ENST00000511273 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.14□□□□□ -1.27
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