RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBE3CQ15386 1083 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 UGT8Q16880 541 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 HOOK2Q96ED9 719 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAXDC2Q96IV6 333 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 CEP72Q9P209 647 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 DPP7Q9UHL4 492 aa5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 NRP1O14786 923 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM20BO75063 409 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 MFAP3LO75121 409 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBP3P10745 1247 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 GNAT2P19087 354 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB27AP51159 221 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDK17Q00537 523 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUSP2Q05923 314 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLF10Q13118 480 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACAP2Q15057 778 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 MFSD5Q6N075 450 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMPRSS6Q8IU80 811 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANP32EQ9BTT0 268 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.34□□□□□ -1.55
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.34□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 NCOA2Q15596 1464 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 E2F8A0AVK6 867 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM75PA6NK02 468 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 AKAP10O43572 662 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM127O75204 238 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLPIP03973 132 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACVRL1P37023 503 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 RABGGTBP53611 331 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPP2R5AQ15172 486 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 TOR2AQ5JU69 321 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 USP51Q70EK9 711 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 ST8SIA2Q92186 375 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 ORAI2Q96SN7 254 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 MNTQ99583 582 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.33□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTPRGP23470 1445 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYOM3Q5VTT5 1437 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLHL33A6NCF5 533 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 FZD9O00144 591 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 RPS6KA4O75676 772 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTHFD2P13995 350 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC25A3Q00325 362 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 TUBA3CQ13748 450 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 XYLT1Q86Y38 959 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL17RAQ96F46 866 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAX2Q96IS3 184 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 MMRN2Q9H8L6 949 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.32□□□□□ -1.56
TIMMDC1-209ENST00000498399 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms