RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.65■■□□□ 1.06
HLA-B-255ENST00000498007 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.65■■□□□ 1.06
HLA-B-255ENST00000498007 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.65■■□□□ 1.06
HLA-B-255ENST00000498007 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.65■■□□□ 1.06
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.65■■□□□ 1.06
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CSPG5O95196 566 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 IGFBP4P22692 258 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 UBE2HP62256 183 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 EHHADHQ08426 723 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 DPYDQ12882 1025 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 GPM6BQ13491 265 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 POSTNQ15063 836 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF558Q96NG5 402 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 SLC39A2Q9NP94 309 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 TRANK1O15050 2925 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.64■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 B4GALT3O60512 393 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 KINO60870 393 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 PNOCQ13519 176 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ADGRE1Q14246 886 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 GBP4Q96PP9 640 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 PLVAPQ9BX97 442 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 MIOSQ9NXC5 875 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.63■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 H3BNC9 293 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 INPPL1O15357 1258 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 DDHD2O94830 711 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 RB1P06400 928 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 BCAR1P56945 870 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 GRIK3Q13003 919 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ACAP3Q96P50 834 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM206Q9H813 350 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CITO14578 2027 aa21.62■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 UBE4BO95155 1302 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 OGTO15294 1046 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 LPXNO60711 386 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 TIGD1Q96MW7 591 aa21.61■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 A0A0B4J269 797 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 PTGESO14684 152 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 GRM6O15303 877 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 FGF18O76093 207 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ITGB1P05556 798 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CXCL8P10145 99 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 PPM1AP35813 382 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 TNFSF9P41273 254 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 SLC11A1P49279 550 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.6■■□□□ 1.05
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HLA-B-255ENST00000498007 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 P2RX5Q93086 422 aa21.6■■□□□ 1.05
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HLA-B-255ENST00000498007 HOXD13P35453 343 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 OR1G1P47890 313 aa21.59■■□□□ 1.05
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HLA-B-255ENST00000498007 MYO9BQ13459 2157 aa21.59■■□□□ 1.05
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HLA-B-255ENST00000498007 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 SPG21Q9NZD8 308 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.59■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 FAM189A1O60320 539 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 RHOBTB3O94955 611 aa21.58■■□□□ 1.05
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