RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489442.5

CCL28-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL28, Length 1,342 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCL28-202ENST00000489442 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.63□□□□□ -0.07
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