RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 GRK4P32298 578 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SOX10P56693 466 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 EHHADHQ08426 723 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SGO2Q562F6 1265 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 NME8Q8N427 588 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TMC2Q8TDI7 906 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 HAUS1Q96CS2 278 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PLCB4Q15147 1175 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 MCF2P10911 925 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 NOVP48745 357 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF536O15090 1300 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 UPP2O95045 317 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 MAP2K2P36507 400 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 HPDLQ96IR7 371 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 KRIT1O00522 736 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 COL1A2P08123 1366 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PQJ5 194 aa8.84□□□□□ -0.99
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