RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM20AQ96MK3 541 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 MTRQ99707 1265 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 COLEC11Q9BWP8 271 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 GPR62Q9BZJ7 368 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXQ1Q9C009 403 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CHST7Q9NS84 486 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 RGL1Q9NZL6 768 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 COL4A3Q01955 1670 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 PTENP60484 403 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP4A11Q02928 519 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 USP41Q3LFD5 358 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 GALNT17Q6IS24 598 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 OTUD6AQ7L8S5 288 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 C1orf210Q8IVY1 113 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 C4orf19Q8IY42 314 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC51Q96ER9 411 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 DYDC2Q96IM9 177 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CSRNP2Q9H175 543 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 POTEMA6NI47 508 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ANHXE9PGG2 379 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 MARCH6O60337 910 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRN2O75325 713 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 MBD3O95983 291 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 GLULP15104 373 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 AKAP5P24588 427 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 AXLP30530 894 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ANAPC15P60006 121 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 STK3Q13188 491 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 EPHA7Q15375 998 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 LILRA6Q6PI73 481 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NEK8Q86SG6 692 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 DCLK2Q8N568 766 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 PJA1Q8NG27 643 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 HAS1Q92839 578 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 KLK14Q9P0G3 267 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 FNIP2Q9P278 1114 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 GIT1Q9Y2X7 761 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 VWA8A3KMH1 1905 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 PATJQ8NI35 1801 aa13.04□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 B4GALT5O43286 388 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ZMYND10O75800 440 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 PAPLNO95428 1278 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 FSHRP23945 695 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 TFDP1Q14186 410 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 TPH2Q8IWU9 490 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 HACE1Q8IYU2 909 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ASAP3Q8TDY4 903 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 RUBCNQ92622 972 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 FGF14Q92915 247 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIP11Q15643 1979 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NOTCH4Q99466 2003 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 TADA2AO75478 443 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NPTXRO95502 500 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 C1RP00736 705 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 GPC5P78333 572 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 NTHL1P78549 312 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CREMQ03060 361 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 CAPSQ13938 189 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 AMHR2Q16671 573 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGEF1-207ENST00000484547 RTP2Q5QGT7 225 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms