RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480940.1

PHF20-210, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-210ENST00000480940 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.12□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.12□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CAPN14A8MX76 684 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 PRRG2O14669 202 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 FPR1P21462 350 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 PCSK1P29120 753 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 FLT3LGP49771 235 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 ATP8B2P98198 1209 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 HHEXQ03014 270 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 SP140Q13342 867 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CDSNQ15517 529 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 HS1BP3Q53T59 392 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 XYLT1Q86Y38 959 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MIER2Q8N344 545 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 ST8SIA2Q92186 375 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 KAT5Q92993 513 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.11□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 NCANO14594 1321 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 ZNF20P17024 532 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 GNAT2P19087 354 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 RABGGTBP53611 331 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 ADAM17P78536 824 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 DSC2Q02487 901 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 Q6ZRM9 215 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MIGA2Q7L4E1 593 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 DOK3Q7L591 496 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MB21D1Q8N884 522 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MIEF2Q96C03 454 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.1□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 B8ZZF3 427 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MFAP3LO75121 409 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 GPR32O75388 356 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 RFPL1O75677 317 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 SCGB1D2O95969 90 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 POU2F2P09086 479 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 IL2RBP14784 551 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 VCAM1P19320 739 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 PDCP20941 246 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 AKAP5P24588 427 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 SCNN1GP51170 649 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CDC42EP1Q00587 391 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 MTM1Q13496 603 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 SPATS1Q496A3 300 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 AFMIDQ63HM1 303 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 USP45Q70EL2 814 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 FAM83AQ86UY5 434 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 TPH2Q8IWU9 490 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 PRR18Q8N4B5 295 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 TMEM140Q9NV12 185 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.09□□□□□ -1.59
PHF20-210ENST00000480940 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 B5MCH6 92 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 HK1P19367 917 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 DDCP20711 480 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 ALDH1A3P47895 512 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 PPP2R5AQ15172 486 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 BMT2Q1RMZ1 405 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 HTR3DQ70Z44 454 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 PALM2Q8IXS6 379 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 CHPFQ8IZ52 775 aa5.08□□□□□ -1.6
PHF20-210ENST00000480940 IFI44Q8TCB0 444 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms