RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	SOX5	P35711	763 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	VAV2	P52735	878 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	LBX1	P52954	281 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	KAT2B	Q92831	832 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	CGRRF1	Q99675	332 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304		F8VZ95	297 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	TRIB2	Q92519	343 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	NT5C1B	Q96P26	610 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	RAB20	Q9NX57	234 aa		18.73	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304		A0A087WZ62	844 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	MYL3	P08590	195 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	RARB	P10826	455 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	MCF2	P10911	925 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	TNNI1	P19237	187 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	MFAP3	P55082	362 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	KIF5A	Q12840	1032 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	SLC18A3	Q16572	532 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ZACN	Q401N2	412 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	SV2A	Q7L0J3	742 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	WDR49	Q8IV35	697 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	NME8	Q8N427	588 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	GABRQ	Q9UN88	632 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		18.72	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ABLIM1	O14639	778 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	IL18RAP	O95256	599 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	EDN1	P05305	212 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ACOT2	P49753	483 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	GNG11	P61952	73 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ADAM17	P78536	824 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	PRKCZ	Q05513	592 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	NLRP7	Q8WX94	980 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	SCLT1	Q96NL6	688 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	SETD4	Q9NVD3	440 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM189A1	O60320	539 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	ERLIN2	O94905	339 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	APBA1	Q02410	837 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	GCNT1	Q02742	428 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	TUBB2A	Q13885	445 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	WDR44	Q5JSH3	913 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF592	Q92610	1267 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	RNF186	Q9NXI6	227 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	SRRD	Q9UH36	339 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	CIT	O14578	2027 aa		18.7	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	PJA2	O43164	708 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	VTN	P04004	478 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	CYP2C9	P11712	490 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	HOXC8	P31273	242 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	CASQ1	P31415	396 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	MAGEA1	P43355	309 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	PRMT2	P55345	433 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	TRPV1	Q8NER1	839 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	DNAI1	Q9UI46	699 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	EVI5	O60447	810 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	TBC1D8	O95759	1140 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	GJB1	P08034	283 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TAPBP-238	ENST00000475304	AXL	P30530	894 aa		18.69	■□□□□ 0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms