RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 GRM5P41594 1212 aa21.81■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CEP120Q8N960 986 aa21.81■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 FIZ1Q96SL8 496 aa21.81■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.81■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 STK39Q9UEW8 545 aa21.81■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TBX20Q9UMR3 447 aa21.81■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 HIDE1A8MVS5 230 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ABLIM1O14639 778 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 PTGESO14684 152 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 PER2O15055 1255 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ABCD1P33897 745 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ADAM15Q13444 863 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 DUSP6Q16828 381 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 EFHBQ8N7U6 833 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC19Q96DA6 116 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 BICD1Q96G01 975 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZBP1Q9H171 429 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CUEDC2Q9H467 287 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 MARCH5Q9NX47 278 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.8■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 FSD2A1L4K1 749 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 LINC01565O15544 149 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CLDN3O15551 220 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CXCL14O95715 111 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 THP07101 528 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CTSAP10619 480 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 BMP1P13497 986 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 LTBRP36941 435 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 OSTNP61366 133 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 KRT85P78386 507 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TUSC3Q13454 348 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 E2F4Q16254 413 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 SFR1Q86XK3 245 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 IQUBQ8NA54 791 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 DHX58Q96C10 678 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.79■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CUL9Q8IWT3 2517 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TTC28Q96AY4 2481 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 DLL1O00548 723 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 GAP43P17677 238 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CA8P35219 290 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 NDUFV1P49821 464 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 LIG4P49917 911 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 GTF2BQ00403 316 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ACAP3Q96P50 834 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TNMDQ9H2S6 317 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TRIP11Q15643 1979 aa21.78■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 TBX10O75333 385 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 PIGRP01833 764 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 IDEP14735 1019 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 MCL1Q07820 350 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 RESP18Q5W5W9 173 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 STAMQ92783 540 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 SPATA32Q96LK8 384 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 IRAK3Q9Y616 596 aa21.77■■□□□ 1.08
CTPS1-206ENST00000470271 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 F8W810 466 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 CITO14578 2027 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 GLP2RO95838 553 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 AMPD3Q01432 767 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 NAB2Q15742 525 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF720Q7Z2F6 126 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.76■■□□□ 1.07
CTPS1-206ENST00000470271 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.76■■□□□ 1.07
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