RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 USP14P54578 494 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PPP2R5DQ14738 602 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 COG2Q14746 738 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 CASP10Q92851 521 aa6.5□□□□□ -1.37
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OPTN-209ENST00000469025 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PARP14Q460N5 1801 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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OPTN-209ENST00000469025 CKBP12277 381 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 ITPKBP27987 946 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 NTF4P34130 210 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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OPTN-209ENST00000469025 PLS1Q14651 629 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 LRRC14Q15048 493 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PLCL1Q15111 1095 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 FZD8Q9H461 694 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SLC32A1Q9H598 525 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 C12orf49Q9H741 205 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 VPS45Q9NRW7 570 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 U3KQE9 123 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 EMSYQ7Z589 1322 aa6.49□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 JMJD1CQ15652 2540 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 CEACAM5P06731 702 aa6.48□□□□□ -1.37
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OPTN-209ENST00000469025 OXCT1P55809 520 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 MTAPQ13126 283 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PICALMQ13492 652 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.48□□□□□ -1.37
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OPTN-209ENST00000469025 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 VAV3Q9UKW4 847 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 CACNA1FO60840 1977 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.47□□□□□ -1.37
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OPTN-209ENST00000469025 FANCGO15287 622 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 CSF1RP07333 972 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 WEE2P0C1S8 567 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 USP17L7P0C7H9 530 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 MPLP40238 635 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 RAP1GAPP47736 663 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 RHBDL3P58872 404 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PRKCQQ04759 706 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PTPN14Q15678 1187 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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OPTN-209ENST00000469025 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 ARMCX2Q7L311 632 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 VPS37DQ86XT2 251 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 MMP21Q8N119 569 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 AFG1LQ8WV93 481 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 FRMD6Q96NE9 622 aa6.47□□□□□ -1.37
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OPTN-209ENST00000469025 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-209ENST00000469025 TTC3P53804 2025 aa6.47□□□□□ -1.37
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