RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF149	Q8NC42	400 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CNNM3	Q8NE01	707 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	NXPE3	Q969Y0	559 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNK12	Q9HB15	430 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF19A	Q9NV58	838 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	PI15	O43692	258 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP6R2	O75170	966 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	YEATS4	O95619	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	KLRC2	P26717	231 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	EFNA5	P52803	228 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	AMHR2	Q16671	573 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	URGCP	Q8TCY9	931 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	PNMA5	Q96PV4	448 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	FZD8	Q9H461	694 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245		E9PMD0	336 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	INPPL1	O15357	1258 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	ERLIN2	O94905	339 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	F13A1	P00488	732 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	ADH1A	P07327	375 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CFH	P08603	1231 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	NPR3	P17342	541 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNK18	Q7Z418	384 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	IGSF21	Q96ID5	467 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245		R4GN57	208 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	TCHH	Q07283	1943 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245	ACACB	O00763	2458 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1B0GUA9	196 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	TSPAN1	O60635	241 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	UROD	P06132	367 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SRF	P11831	508 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CDC25A	P30304	524 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ABCD1	P33897	745 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	MAPK7	Q13164	816 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	BECN1	Q14457	450 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	NOTUM	Q6P988	496 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	DAW1	Q8N136	415 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SHD	Q96IW2	340 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	GBP3	Q9H0R5	595 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	CA14	Q9ULX7	337 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-223	ENST00000466245	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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