RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 CD276Q5ZPR3 534 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 MYLIPQ8WY64 445 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 DTLQ9NZJ0 730 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 PRSS50Q9UI38 385 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.31□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 CYP27B1O15528 508 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 PCDH8O95206 1070 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 HRGP04196 525 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 CELA3BP08861 270 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SDHBP21912 280 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC16A1P53985 500 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 PRR5P85299 388 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SPIDRQ14159 915 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC9A5Q14940 896 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 ANO4Q32M45 955 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 DTX1Q86Y01 620 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 AMNQ9BXJ7 453 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 HSPBP1Q9NZL4 362 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 NUDT19A8MXV4 375 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 H3BML4 177 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 TUSC2O75896 110 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 RAC2P15153 192 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 EDNRBP24530 442 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SERPINB3P29508 390 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 PPARAQ07869 468 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 NR1I3Q14994 352 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 PROSER1Q86XN7 944 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 MIB1Q86YT6 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 DENND1CQ8IV53 801 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 MTG2Q9H4K7 406 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 MAP3K5Q99683 1374 aa7.29□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 CCDC154A6NI56 674 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 DTNBO60941 627 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC5A1P13866 664 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 SPINK2P20155 84 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 BCAR1P56945 870 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 ADRM1Q16186 407 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 PGS1Q32NB8 556 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 TEPPQ6URK8 271 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 RPTNQ6XPR3 784 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 CALML6Q8TD86 181 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 NRG4Q8WWG1 115 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 GJA10Q969M2 543 aa7.28□□□□□ -1.24
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PRPF4B-204ENST00000466185 RNF32Q9H0A6 362 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 INCENPQ9NQS7 918 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 INTUQ9ULD6 942 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 USP18Q9UMW8 372 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 IPPQ9Y573 584 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.28□□□□□ -1.24
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF839A8K0R7 811 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM227AF5H4B4 570 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF4B-204ENST00000466185 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF4B-204ENST00000466185 B3GALT2O43825 422 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF4B-204ENST00000466185 OPHN1O60890 802 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF4B-204ENST00000466185 UBXN7O94888 489 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF4B-204ENST00000466185 MPOP05164 745 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF4B-204ENST00000466185 MYL3P08590 195 aa7.27□□□□□ -1.25
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