RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS52Q8N1B4 723 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX12PQ92771 950 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 CUEDC2Q9H467 287 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 MIOSQ9NXC5 875 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087X0B3 334 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 THP07101 528 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 GAP43P17677 238 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 PROZP22891 400 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 GRM5P41594 1212 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 TUSC3Q13454 348 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB33Q86T24 672 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 EFHBQ8N7U6 833 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 IQUBQ8NA54 791 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHA7Q9UN72 937 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 MYMKA6NI61 221 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 CLDN3O15551 220 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFV1P49821 464 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 LIG4P49917 911 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNQ1P51787 676 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 AMPD3Q01432 767 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAM15Q13444 863 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 DUSP6Q16828 381 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 SHC4Q6S5L8 630 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ACAP3Q96P50 834 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBP1Q9H171 429 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 TNMDQ9H2S6 317 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 TBX20Q9UMR3 447 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM50BQ9Y247 325 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP1-205ENST00000466097 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PTGESO14684 152 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PER2O15055 1255 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CXCL14O95715 111 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CTSAP10619 480 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 IDEP14735 1019 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 OSTNP61366 133 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 GTF2BQ00403 316 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SFR1Q86XK3 245 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP120Q8N960 986 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 DHX58Q96C10 678 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 HVCN1Q96D96 273 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA32Q96LK8 384 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MARCH5Q9NX47 278 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MUC3AQ02505 3323 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 HIDE1A8MVS5 230 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ABLIM1O14639 778 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01565O15544 149 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 PIGRP01833 764 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 URODP06132 367 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 BMP1P13497 986 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MCL1Q07820 350 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 E2F4Q16254 413 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 RESP18Q5W5W9 173 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 FIZ1Q96SL8 496 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 IRAK3Q9Y616 596 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 ANK1P16157 1881 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1-205ENST00000466097 TBX10O75333 385 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms