RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 ZPBP2Q6X784 338 aa22.73■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 VPS52Q8N1B4 723 aa22.73■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 CEP120Q8N960 986 aa22.73■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 FIZ1Q96SL8 496 aa22.73■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.73■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 HIDE1A8MVS5 230 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 PTGESO14684 152 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 LINC01565O15544 149 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 CA8P35219 290 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 OSTNP61366 133 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 KRT85P78386 507 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 E2F4Q16254 413 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 SFR1Q86XK3 245 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 EFHBQ8N7U6 833 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 DHX58Q96C10 678 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 ZBP1Q9H171 429 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 MARCH5Q9NX47 278 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 TBX20Q9UMR3 447 aa22.72■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 PER2O15055 1255 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 THP07101 528 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 ABCD1P33897 745 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 LIG4P49917 911 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 ADAM15Q13444 863 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 DUSP6Q16828 381 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 CUEDC2Q9H467 287 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 STK39Q9UEW8 545 aa22.71■■□□□ 1.23
VARS-218ENST00000459667 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CLDN3O15551 220 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 IDEP14735 1019 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 GAP43P17677 238 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 LTBRP36941 435 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 GTF2BQ00403 316 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 TUSC3Q13454 348 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 RESP18Q5W5W9 173 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 IQUBQ8NA54 791 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 SPATA32Q96LK8 384 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.7■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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VARS-218ENST00000459667 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.7■■□□□ 1.22
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VARS-218ENST00000459667 TRIP11Q15643 1979 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 FSD2A1L4K1 749 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 TBX10O75333 385 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CXCL14O95715 111 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PIGRP01833 764 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CTSAP10619 480 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 BMP1P13497 986 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 NDUFV1P49821 464 aa22.69■■□□□ 1.22
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VARS-218ENST00000459667 MCL1Q07820 350 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 STAMQ92783 540 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 ACAP3Q96P50 834 aa22.69■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.69■■□□□ 1.22
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VARS-218ENST00000459667 F8W810 466 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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VARS-218ENST00000459667 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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VARS-218ENST00000459667 SNX27Q96L92 541 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CITO14578 2027 aa22.68■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 GLP2RO95838 553 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 SOD2P04179 222 aa22.67■■□□□ 1.22
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