RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453707.6

CITED1-209, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene CITED1, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-209ENST00000453707 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 H0Y858 1186 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 MUTP22033 750 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 NAMPTP43490 491 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 TRAPPC10P48553 1259 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ST3GAL1Q11201 340 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 FAM187BQ17R55 369 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 HASPINQ8TF76 798 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PHOX2BQ99453 314 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 KCNK12Q9HB15 430 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 CHST7Q9NS84 486 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 GDAQ9Y2T3 454 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.58□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ACKR2O00590 384 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 TGM5O43548 720 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 RFPL2O75678 378 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 RPL17P18621 184 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 EFNA5P52803 228 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 BSNDQ8WZ55 320 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 KIFAP3Q92845 792 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 TTPALQ9BTX7 342 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 FNIP2Q9P278 1114 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 KIF3AQ9Y496 699 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 CLUHO75153 1309 aa14.57□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 CCDC169A6NNP5 214 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 K7ERI5 159 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 RECQL4O94761 1208 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 LIN9Q5TKA1 542 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 KRT79Q5XKE5 535 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 GPR65Q8IYL9 337 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 POLD4Q9HCU8 107 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 DNM3Q9UQ16 869 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 USP20Q9Y2K6 914 aa14.56□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ARID2Q68CP9 1835 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 C1RP00736 705 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 CLCN5P51795 746 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 NBR1Q14596 966 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PSMD5Q16401 504 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 MCTP1Q6DN14 999 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PDXDC1Q6P996 788 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 POLIQ9UNA4 740 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.55□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 GFRA3O60609 400 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 KIF4AO95239 1232 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 EFEMP2O95967 443 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 CFHP08603 1231 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PTGDRQ13258 359 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PDIA5Q14554 519 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 RTP2Q5QGT7 225 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 SIX5Q8N196 739 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 NXPE3Q969Y0 559 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 TCHPQ9BT92 498 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 PTGESO14684 152 aa14.53□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 TRAPPC3O43617 180 aa14.53□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 XYLBO75191 536 aa14.53□□□□□ -0.08
CITED1-209ENST00000453707 ZMYND10O75800 440 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms