RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 CUL4AQ13619 759 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FAM187BQ17R55 369 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PHKBQ93100 1093 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CEP170P1Q96L14 293 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MTRQ99707 1265 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 YY1AP1Q9H869 796 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CHST7Q9NS84 486 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 HCSTQ9UBK5 93 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 STK24Q9Y6E0 443 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NRP1O14786 923 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 AK2P54819 239 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 EMC2Q15006 297 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 USP41Q3LFD5 358 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 UBXN11Q5T124 520 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MTSS1LQ765P7 747 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MAFFQ9ULX9 164 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ANHXE9PGG2 379 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CSPG5O95196 566 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CA8P35219 290 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 UVSSAQ2YD98 709 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NLRP4Q96MN2 994 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 KCNK12Q9HB15 430 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TDP2O95551 362 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PRKCQQ04759 706 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NPY5RQ15761 445 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 KRT222Q8N1A0 295 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 UROC1Q96N76 676 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRR-204ENST00000440835 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 IPPQ9Y573 584 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MYO10Q9HD67 2058 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MARCH6O60337 910 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TSPAN1O60635 241 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DDHD2O94830 711 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NPR3P17342 541 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ARL2P36404 184 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PFKPQ01813 784 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DRP2Q13474 957 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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PTPRR-204ENST00000440835 NELL2Q99435 816 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PHOX2BQ99453 314 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 LXNQ9BS40 222 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MARCH5Q9NX47 278 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ARL5CA6NH57 179 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 N4BP3O15049 544 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 AP5Z1O43299 807 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PFKFB2O60825 505 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 XYLBO75191 536 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PDCP20941 246 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FGFR4P22455 802 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PBX3P40426 434 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 STARD6P59095 220 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SYCP1Q15431 976 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 INF2Q27J81 1249 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 XKR9Q5GH70 373 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 LILRA6Q6PI73 481 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 RNF149Q8NC42 400 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 LPPQ93052 612 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.62□□□□□ -1.35
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