RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 KRT31Q15323 416 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 ARHGAP24Q8N264 748 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 TBX3O15119 743 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 ALDH2P05091 517 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 ZNF445P59923 1031 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 PRAMEP78395 509 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 LCMT1Q9UIC8 334 aa12.85□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 FAM47DPA6NHR8 397 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CKMP06732 381 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CXCR5P32302 372 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CYP2C19P33261 490 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 PRCPP42785 496 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 ARMC6Q6NXE6 501 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 FGD4Q96M96 766 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 MED15Q96RN5 788 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CYP26B1Q9NR63 512 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 EPHB3P54753 998 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 GPC5P78333 572 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 PPIL2Q13356 520 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 LY6KQ17RY6 165 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 IP6K2Q9UHH9 426 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 TMX2Q9Y320 296 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CHGBP05060 677 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 IL1R1P14778 569 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 KLRC1P26715 233 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 AKT1P31749 480 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 PDIA5Q14554 519 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 TMED2Q15363 201 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 AMHR2Q16671 573 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 NUP85Q9BW27 656 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 UNC45AQ9H3U1 944 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CFAP69A5D8W1 941 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 H0Y626 953 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CDH18Q13634 790 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 PTK2BQ14289 1009 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 REEP2Q9BRK0 252 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CEP72Q9P209 647 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 TTC36A6NLP5 189 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 MFSD10Q14728 455 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 CPB2Q96IY4 423 aa12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NEK1-201ENST00000439128 NDUFAB1O14561 156 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 ACADMP11310 421 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 HADHAP40939 763 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 AMPD2Q01433 879 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 CHSY1Q86X52 802 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 OR6P1Q8NGX9 317 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 PREX1Q8TCU6 1659 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 SYF2O95926 243 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 SERPIND1P05546 499 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 GHRP10912 638 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 AVPR1AP37288 418 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 PNPLA4P41247 253 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 ACVR2BQ13705 512 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 STILQ15468 1287 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 PDIK1LQ8N165 341 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 CEP120Q8N960 986 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 RMDN2Q96LZ7 410 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 TOM1L1O75674 476 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 EGFRP00533 1210 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 TAC1P20366 129 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 BEX3Q00994 111 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 IKBKEQ14164 716 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 ADCK2Q7Z695 626 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 LRRC8CQ8TDW0 803 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 DNAJB3Q8WWF6 145 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 ULK4Q96C45 1275 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 VCXQ9H320 206 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 MSCO60682 206 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 CLTAP09496 248 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 BCAR1P56945 870 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 ELF2Q15723 593 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 ACRBPQ8NEB7 543 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 OSMRQ99650 979 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 NT5C1AQ9BXI3 368 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 FAM114A2Q9NRY5 505 aa12.83□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 TMEM247A6NEH6 219 aa12.82□□□□□ -0.36
NEK1-201ENST00000439128 H3BRB1 525 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms