RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428527.1

TTC27-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

TSL 3

Gene TTC27, Length 687 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-202ENST00000428527 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 HAS1Q92839 578 aa7.42□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 SLC2A13Q96QE2 648 aa7.42□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 MENTQ9BUN1 341 aa7.42□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.42□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 POGKQ9P215 609 aa7.42□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 AHRRA9YTQ3 701 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 AGXTP21549 392 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 NR4A1P22736 598 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 SREBF1P36956 1147 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 NHLH2Q02577 135 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 CLUL1Q15846 466 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 AMER2Q8N7J2 671 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 LANCL2Q9NS86 450 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 DNM3Q9UQ16 869 aa7.41□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 ENDOD1O94919 500 aa7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 MGAT1P26572 445 aa7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 SYT12Q8IV01 421 aa7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 LENG9Q96B70 501 aa7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 LDAHQ9H6V9 325 aa7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TTC27-202ENST00000428527 TRIM75PA6NK02 468 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 PJA2O43164 708 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 MT-CO1P00395 513 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 RBP3P10745 1247 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 CLRN1P58418 232 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 RAP2BP61225 183 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 TGFB2P61812 414 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 MGAT2Q10469 447 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 SP140Q13342 867 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ZNF627Q7L945 461 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 MRGPREQ86SM8 312 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 FZD1Q9UP38 647 aa7.39□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 WNT10BO00744 389 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ITGB1P05556 798 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 RAP2AP10114 183 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 IL2RBP14784 551 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 GUCY2FP51841 1108 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 FAM189BP81408 668 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 AMPD3Q01432 767 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 SEPT2Q15019 361 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 AFMIDQ63HM1 303 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 PPM1NQ8N819 430 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 MTMR8Q96EF0 704 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 MKS1Q9NXB0 559 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.38□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 DIRC3C9JPN6 131 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 PPFIA4O75335 1185 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 GUCY1A2P33402 732 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 INAVAQ3KP66 663 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 STON2Q8WXE9 905 aa7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 NCR1O76036 304 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ABHD16AO95870 558 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 SPATA31D3P0C874 917 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 MYBL2P10244 700 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 LAG3P18627 525 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ALDH1A3P47895 512 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 CHN2P52757 468 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 ITKQ08881 620 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC27-202ENST00000428527 MTMR1Q13613 665 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms