RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAB2Q15742 525 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLPP4Q5VZY2 271 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS6KC1Q96S38 1066 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TCHPQ9BT92 498 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FRMD3A2A2Y4 597 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIDE1A8MVS5 230 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC01565O15544 149 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LTBRP36941 435 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR1G1P47890 313 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRIP1P48552 1158 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OSTNP61366 133 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF720Q7Z2F6 126 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQUBQ8NA54 791 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA32Q96LK8 384 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNMDQ9H2S6 317 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CUEDC2Q9H467 287 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CACNG4Q9UBN1 327 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PER2O15055 1255 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIGRP01833 764 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HARSP12081 509 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCP2P22307 547 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNA5P22460 613 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNQ1P51787 676 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MCL1Q07820 350 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALKAL1Q6UXT8 129 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMC7Q7Z402 723 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS52Q8N1B4 723 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STRA6Q9BX79 667 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBP1Q9H171 429 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLDND1Q9NY35 253 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM13BQ9NYF5 915 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R37O75864 691 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EFEMP2O95967 443 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAP43P17677 238 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAM15Q13444 863 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEZ6Q53EL9 994 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC39A4Q6P5W5 647 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP4K3Q8IVH8 894 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RABGGTAQ92696 567 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BICD1Q96G01 975 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAAF1Q9BRP4 392 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TLE6Q9H808 572 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D7Q9P0N9 293 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEL1LQ9UBV2 794 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C2orf71A6NGG8 1288 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLDN3O15551 220 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCK2O43639 380 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THP07101 528 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IDEP14735 1019 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XKR4Q5GH76 650 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TJAP1Q5JTD0 557 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLRA4Q5JXX5 417 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EFHBQ8N7U6 833 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AUTS2Q8WXX7 1259 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP2R3CQ969Q6 453 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM9Q9C026 710 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IKZF4Q9H2S9 585 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNH3Q9ULD8 1083 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3BQ06 376 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BMP1P13497 986 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LIG4P49917 911 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM10P98175 930 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TUSC3Q13454 348 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DUSP6Q16828 381 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADALQ6DHV7 355 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAS1R1Q7RTX1 841 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VN1R2Q8NFZ6 395 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACAP3Q96P50 834 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PANK4Q9NVE7 773 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASTOR2A6NHX0 329 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TISP43B9A030 160 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD63C9JTQ0 380 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBX10O75333 385 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CXCL14O95715 111 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLP2RO95838 553 aa27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms