RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419303.5

PRAMENP-202, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,869 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-202ENST00000419303 LMNB2Q03252 620 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 LETM2Q2VYF4 491 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 WDR78Q5VTH9 848 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 HGSNATQ68CP4 663 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CENPPQ6IPU0 288 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CDHR1Q96JP9 859 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM20AQ96MK3 541 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 VTA1Q9NP79 307 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CEP72Q9P209 647 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SRRDQ9UH36 339 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 LCTP09848 1927 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ENO4A6NNW6 628 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RGS20O76081 388 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 KIF4AO95239 1232 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TGFB3P10600 412 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FERP16591 822 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ATP11AP98196 1134 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 B3GNT9Q6UX72 402 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 DPP9Q86TI2 863 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NLRX1Q86UT6 975 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 MFN1Q8IWA4 741 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TINF2Q9BSI4 451 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RAB17Q9H0T7 212 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ZFATQ9P243 1243 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC37A4O43826 429 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PPFIA2O75334 1257 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CHN1P15882 459 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 KLRC1P26715 233 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PPARDQ03181 441 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 STK4Q13043 487 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC18A3Q16572 532 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 GNPTABQ3T906 1256 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 MDM1Q8TC05 714 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC5A5Q92911 643 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 AK8Q96MA6 479 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM210AQ96ND0 272 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RIT2Q99578 217 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SENP7Q9BQF6 1050 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TRIM9Q9C026 710 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ECT2Q9H8V3 914 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PLXNB2O15031 1838 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NFASCO94856 1347 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CCDC169A6NNP5 214 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 KRIT1O00522 736 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ABLIM1O14639 778 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 DAPK3O43293 454 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC26A4O43511 780 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 WFS1O76024 890 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 OR52Z1P0C646 297 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 MMP13P45452 471 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ARMCX2Q7L311 632 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CABP7Q86V35 215 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 HAS1Q92839 578 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PGM2Q96G03 612 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PLIN2Q99541 437 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TSG101Q99816 390 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms