RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 AMNQ9BXJ7 453 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TRIM7Q9C029 511 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 LRRC19Q9H756 370 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TAC1P20366 129 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 IVDP26440 423 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ATP5DP30049 168 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NFIL3Q16649 462 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CNBD1Q8NA66 436 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SPOCK2Q92563 424 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 WHRNQ9P202 907 aa14.18□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ATP2B4P23634 1241 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 UBXN2AP68543 259 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 MTFR1Q15390 333 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF653Q96CK0 615 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 C9orf72Q96LT7 481 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 MAGEB18Q96M61 343 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 BLMHQ13867 455 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RNF43Q68DV7 783 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 FBXO11Q86XK2 927 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ERP27Q96DN0 273 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 WDR18Q9BV38 432 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 HAO1Q9UJM8 370 aa14.17□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SPAG7O75391 227 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CALCAP01258 141 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ITIH2P19823 946 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ADCY8P40145 1251 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CACNB3P54284 484 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 VSIG1Q86XK7 387 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CERS5Q8N5B7 392 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SAAL1Q96ER3 474 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 HIP1RO75146 1068 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 GM2AP17900 193 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CIITAP33076 1130 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 DNAJC3Q13217 504 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TCEAL1Q15170 157 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 FBF1Q8TES7 1133 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SNF8Q96H20 258 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 FSCN2O14926 492 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TOM1O60784 492 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 VAMP7P51809 220 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 FMO1Q01740 532 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TCP10Q12799 353 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.16□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RASA4BC9J798 803 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RGL2O15211 777 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RASA4O43374 803 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 MTA2O94776 668 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 LINGO3P0C6S8 592 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TMED2Q15363 201 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 CHKBQ9Y259 395 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 STK24Q9Y6E0 443 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 HLA-DOAP06340 250 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 RFX1P22670 979 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 STRN3Q13033 797 aa14.15□□□□□ -0.14
ZBED8-201ENST00000408953 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms