RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG7O75391 227 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CDK17Q00537 523 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 KRT33BQ14525 404 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR2P61160 394 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ELMOD1Q8N336 334 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 AFG1LQ8WV93 481 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SIK2Q9H0K1 926 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SENP1Q9P0U3 644 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 USP49Q70CQ1 688 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 RIT2Q99578 217 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 SPON2Q9BUD6 331 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 PID1Q7Z2X4 250 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.46■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.45■■□□□ 1.03
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ARSEP51690 589 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 GALCP54803 685 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RBP5P82980 135 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 POU5F1BQ06416 359 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 HIPK4Q8NE63 616 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ULK4Q96C45 1275 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SP110Q9HB58 689 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TYK2P29597 1187 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 STAT4Q14765 748 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NR1I3Q14994 352 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NUDCD3Q8IVD9 361 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 OR6P1Q8NGX9 317 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 HSD17B4P51659 736 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM5Q71RC9 77 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 EPC1Q9H2F5 836 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MAFGO15525 162 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ARFIP2P53365 341 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 KRT17Q04695 432 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NRBF2Q96F24 287 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CYTH2Q99418 400 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.45■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CNPY4Q8N129 248 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MADDQ8WXG6 1647 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM247A6NEH6 219 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PYGBP11216 843 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RPA1P27694 616 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ACOT2P49753 483 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 HIF1AQ16665 826 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NCAPHQ15003 741 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM143Q96AN5 459 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 EPAS1Q99814 870 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 APOL1O14791 398 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB2O15479 319 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2C19P33261 490 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA9P43362 315 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NCOA4Q13772 614 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 VGLL3A8MV65 326 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 IFNA8P32881 189 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RCOR2Q8IZ40 523 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms