RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF229Q9UJW7 825 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GTH6 734 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 BIRC5O15392 142 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MAFGO15525 162 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MAPTP10636 758 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TGFBR2P37173 567 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK9P45984 424 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC15Q0P6D6 951 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 STX5Q13190 355 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TUBA3CQ13748 450 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 STYK1Q6J9G0 422 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 LUZP2Q86TE4 346 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MYCT1Q8N699 235 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MB21D1Q8N884 522 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ING2Q9H160 280 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RNF181Q9P0P0 153 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC3Q13217 504 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 JADE1Q6IE81 842 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP10Q86W26 655 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 ISCUQ9H1K1 167 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 COPEO14579 308 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 NVLO15381 856 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PHF2O75151 1096 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 CALB2P22676 271 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 AMNQ9BXJ7 453 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ANKHQ9HCJ1 492 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 GSTA4O15217 222 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A2O15244 555 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 TTC8Q8TAM2 541 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 SCN3BQ9NY72 215 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 L3MBTL1Q9Y468 752 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF532Q9HCE3 1301 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 CCT8L1PA6NM43 557 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 ADCY6O43306 1168 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TTLL1O95922 423 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 PMS2P54278 862 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 SLFN13Q68D06 897 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF544Q6NX49 715 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 TTC27Q6P3X3 843 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRD-201ENST00000355233 DPP9Q86TI2 863 aa5.19□□□□□ -1.58
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