RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355216.5

FOXN4-202, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene FOXN4, Length 2,958 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-202ENST00000355216 TTI1O43156 1089 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 GLRA2P23416 452 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 CDR2Q01850 454 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 CUL1Q13616 776 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 KRT35Q92764 455 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 PORCNQ9H237 461 aa14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FOXN4-202ENST00000355216 GRIN3BO60391 1043 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 COMTP21964 271 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 MESDQ14696 234 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ZSCAN26Q16670 478 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 TTMPQ5BVD1 217 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CFAP58Q5T655 872 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 WDR90Q96KV7 1748 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CEP89Q96ST8 783 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 RUFY1Q96T51 708 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 KRT5P13647 590 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 COPB2P35606 906 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ARL2P36404 184 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ACOT2P49753 483 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 PDE6CP51160 858 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ENPEPQ07075 957 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 STRN3Q13033 797 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 BTBD6Q96KE9 485 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 PCYT2Q99447 389 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 DAPK3O43293 454 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 MTA2O94776 668 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 KRT14P02533 472 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CYP1A2P05177 515 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 MARCKSL1P49006 195 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CLDN10P78369 228 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 NUP85Q9BW27 656 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.64□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CLSTN1O94985 981 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 PPFIA1Q13136 1202 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 PSMD6Q15008 389 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 DEPTORQ8TB45 409 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ADM5C9JUS6 153 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 K7ERI5 159 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ABCD1P33897 745 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 NAMPTP43490 491 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 GCNT1Q02742 428 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 TRPC6Q9Y210 931 aa14.63□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 PTPRJQ12913 1337 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 TNNI1P19237 187 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 FLT3P36888 993 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 PEX5P50542 639 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 PTENP60484 403 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 ZNF653Q96CK0 615 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 FNBP1Q96RU3 617 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.62□□□□□ -0.07
FOXN4-202ENST00000355216 FBXO40Q9UH90 709 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms