RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 CREB3O43889 395 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 GJB7Q6PEY0 223 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.01■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 RSPH10B2B2RC85 870 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 RSPH10BP0C881 870 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 CDH6P55285 790 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 KRT3P12035 628 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 NCAPHQ15003 741 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 FIS1Q9Y3D6 152 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SREBF1P36956 1147 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 JADE1Q6IE81 842 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SCN4BQ8IWT1 228 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ATL2Q8NHH9 583 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TMEM253P0C7T8 217 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 STX1BP61266 288 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ROR1Q01973 937 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TMPRSS15P98073 1019 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 C18orf8Q96DM3 657 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC7Q99615 494 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 P4HA2O15460 535 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 HLA-DRAP01903 254 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 RFC5P40937 340 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 HACL1Q9UJ83 578 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ARSEP51690 589 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ANKS1AQ92625 1134 aa21.99■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 FGFR4P22455 802 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TSPY1Q01534 308 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 PPM1NQ8N819 430 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SEMA6BQ9H3T3 888 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 A0A0G2JND7 137 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 GMCL1Q96IK5 515 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 PHF2O75151 1096 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.115e-12■■■■■ 104.3
NISCH-201ENST00000345716 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 GBP5Q96PP8 586 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ZNF560Q96MR9 790 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 NLRP14Q86W24 1093 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SPDYE6P0CI01 402 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 CHST13Q8NET6 341 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 GPRASP2Q96D09 838 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.97■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 ARP10275 920 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 RDM1Q8NG50 284 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 HVCN1Q96D96 273 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 COG7P83436 770 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-201ENST00000345716 F5H423 210 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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