RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315392.8

PLXDC1-201, Transcript of plexin domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLXDC1, Length 6,252 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1-201ENST00000315392 ACOT2P49753 483 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 RAD23BP54727 409 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 LRRC74AQ0VAA2 488 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 SPDYE7PQ495Y7 208 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TMEM143Q96AN5 459 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 SUPT3HO75486 399 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 NUMBP49757 651 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 USP6P35125 1406 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TSPOAP1O95153 1857 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 PDGFRBP09619 1106 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 GUCY1A3Q02108 690 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ELP3Q9H9T3 547 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 PARVAQ9NVD7 372 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 BARHL2Q9NY43 387 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 DONSONQ9NYP3 566 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 GRAP2O75791 330 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 KRT7P08729 469 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 GFAPP14136 432 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 YAF2Q8IY57 180 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 NLRP1Q9C000 1473 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.95■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 PPP3CCP48454 512 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 C2orf40Q9H1Z8 148 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 FBXO40Q9UH90 709 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 HMGCS2P54868 508 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 MAN1A2O60476 641 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TLR2O60603 784 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TPI1P60174 286 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 CAV1Q03135 178 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 DMC1Q14565 340 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 VCAM1P19320 739 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 DEUP1Q05D60 604 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 MTMR2Q13614 643 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 IGKV5-2P06315 115 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 AKR1B1P15121 316 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 FAM20AQ96MK3 541 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 BFARQ9NZS9 450 aa15.94■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 RALAP11233 206 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ARIH2O95376 493 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 SYTL3Q4VX76 610 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 NDE1Q9NXR1 346 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 RPS6KA4O75676 772 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 AGPAT1Q99943 283 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ACAD9Q9H845 621 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 LZTS1Q9Y250 596 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TCP11X1B4DZS4 312 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 SFNP31947 248 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 COL15A1P39059 1388 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 LONRF1Q17RB8 773 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 ASAP2O43150 1006 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 CHGBP05060 677 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 KRT72Q14CN4 511 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 MFN1Q8IWA4 741 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 MTBPQ96DY7 904 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 SCP2P22307 547 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.92■□□□□ 0.14
PLXDC1-201ENST00000315392 PRKCBP05771 671 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms