RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SPATA21Q7Z572 469 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 LPAR1Q92633 364 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PICK1Q9NRD5 415 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 GGT7Q9UJ14 662 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 KRIT1O00522 736 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 LRRN2O75325 713 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 RNF8O76064 485 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 POTEAQ6S8J7 498 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PALB2Q86YC2 1186 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TEPSINQ96N21 525 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 EGFRP00533 1210 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 FLT3P36888 993 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 HSD17B3P37058 310 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PPP2R2AP63151 447 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 GHRHRQ02643 423 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 ZNF844Q08AG5 666 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TKFCQ3LXA3 575 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PADI6Q6TGC4 694 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 P3H4Q92791 437 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TISP43B9A030 160 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 MYL7Q01449 175 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SLMAPQ14BN4 828 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TNIP1Q15025 636 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 RFFLQ8WZ73 363 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 NR2E1Q9Y466 385 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 H0YGN5 161 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TMEM253P0C7T8 217 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 COPB2P35606 906 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 BFSP1Q12934 665 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 CUL1Q13616 776 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 LMO3Q8TAP4 145 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 NFS1Q9Y697 457 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 CCDC188H7C350 402 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 K7ENM7 598 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PPATQ06203 517 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 DAPK3O43293 454 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TRIM31Q9BZY9 425 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PARP14Q460N5 1801 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TTI1O43156 1089 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 EXOC3O60645 756 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 ALADP13716 330 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TEKT4Q8WW24 435 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PIM2Q9P1W9 311 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 MTMR1Q13613 665 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TNFAIP1Q13829 316 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 MYBPC2Q14324 1141 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TAF11Q15544 211 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 HHATQ5VTY9 493 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 JDP2Q8WYK2 163 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.59■■□□□ 1.05
HPS6-201ENST00000299238 DPH5Q9H2P9 285 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms