RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 ALG6Q9Y672 507 aa25.79■■□□□ 1.72
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TRIM54-201ENST00000296098 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
TRIM54-201ENST00000296098 CLUL1Q15846 466 aa25.78■■□□□ 1.72
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TRIM54-201ENST00000296098 C1orf112Q9NSG2 853 aa25.78■■□□□ 1.72
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TRIM54-201ENST00000296098 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.77■■□□□ 1.72
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TRIM54-201ENST00000296098 ARL2P36404 184 aa25.76■■□□□ 1.72
TRIM54-201ENST00000296098 DLK2Q6UY11 383 aa25.76■■□□□ 1.72
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TRIM54-201ENST00000296098 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.76■■□□□ 1.72
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TRIM54-201ENST00000296098 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa25.76■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF653Q96CK0 615 aa25.76■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 IQCKQ8N0W5 287 aa25.75■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF516Q92618 1163 aa25.75■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.74■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.74■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 SULF1Q8IWU6 871 aa25.74■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 K7ERI5 159 aa25.73■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 ZACNQ401N2 412 aa25.73■■□□□ 1.71
TRIM54-201ENST00000296098 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.73■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 UVRAGQ9P2Y5 699 aa25.73■■□□□ 1.71
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TRIM54-201ENST00000296098 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
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