RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264266.12

MFSD1-201, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD1, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-201ENST00000264266 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.47■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 GPD1LQ8N335 351 aa20.47■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.47■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.47■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.47■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 SCN5AQ14524 2016 aa20.47■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 ADRB2P07550 413 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 TRIM49P0CI25 452 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 TRIM49CP0CI26 452 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 RRAGAQ7L523 313 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 RNF149Q8NC42 400 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 TMC2Q8TDI7 906 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 SAAL1Q96ER3 474 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 SCLYQ96I15 445 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 LRRC53A6NM62 1247 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 PMM2O15305 246 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 TIMP1P01033 207 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 CCDC175P0C221 793 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 CLCN3P51790 818 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 POU5F1BQ06416 359 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 PTPN14Q15678 1187 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 CBWD6Q4V339 395 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 ZPBP2Q6X784 338 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 METTL13Q8N6R0 699 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 GCNT4Q9P109 453 aa20.46■□□□□ 0.87
MFSD1-201ENST00000264266 EXTL3O43909 919 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 ACTN1P12814 892 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 DLG4P78352 724 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 SIX2Q9NPC8 291 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 MYO6Q9UM54 1294 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 NRCAMQ92823 1304 aa20.45■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 TUBB4AP04350 444 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 CTSHP09668 335 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 TNNT1P13805 278 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 UCHL3P15374 230 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 CSF2RAP15509 400 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 TMOD1P28289 359 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 ADAM17P78536 824 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 MYL7Q01449 175 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 MAPK6Q16659 721 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 USP37Q86T82 979 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 SERINC5Q86VE9 423 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 GDF15Q99988 308 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 DESI2Q9BSY9 194 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.44■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 ZNF233A6NK53 670 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 NDUFA10O95299 355 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 EPHB4P54760 987 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 PTENP60484 403 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 APBA1Q02410 837 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 CYP24A1Q07973 514 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 PPP3CAQ08209 521 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 CETN1Q12798 172 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 PTK7Q13308 1070 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 FZD8Q9H461 694 aa20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 A0A0B4J269 797 aa20.42■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 EDN1P05305 212 aa20.42■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 PRKCBP05771 671 aa20.42■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 GNAT1P11488 350 aa20.42■□□□□ 0.86
MFSD1-201ENST00000264266 GTF2H1P32780 548 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms